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病原菌為瓜鏈格孢，屬半知菌亞門真菌。
甜瓜葉枯病病菌主要危害葉片。真葉染病初見褐色小點，后病斑逐漸擴大，輪紋不明顯，但病健部邊界明顯，病斑邊緣呈水漬狀，發(fā)病后期幾個病斑匯合成大斑，致葉片干枯。果實染病的癥狀與葉片類似，病菌可侵入果肉，導致果實腐爛。
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