畜牧家禽網(wǎng)首頁 > 技術(shù)中心> 國內(nèi)綜合 > 云南完成草地貪夜蛾染色體基因組組裝(圖)
畜牧家禽網(wǎng) 來源:云南日報(bào) 閱讀數(shù):
云南農(nóng)業(yè)大學(xué)、深圳華大生命科學(xué)研究院等單位合作開展草地貪夜蛾成蟲個(gè)體大片段基因組DNA提取、建庫、測序和組裝,目前完成了2個(gè)染色體水平的基因組測序和組裝,這是全球首次完成草地貪夜蛾染色體級別的基因組組裝,將為草地貪夜蛾后續(xù)研究提供重要的遺傳資源。
據(jù)介紹,外來入侵害蟲草地貪夜蛾傳播擴(kuò)散迅速,適生區(qū)域廣泛,寄主植物多,危害大。5月份后,隨著西南夏季風(fēng)的加強(qiáng),云南和廣西成為緬甸蟲源的主要遷入地,并波及到貴州、廣東、海南、湖南等省。為此,云南農(nóng)業(yè)大學(xué)、深圳華大基因研究院等單位的研究人員開展了草地貪夜蛾在云南的災(zāi)變機(jī)理及控制研究。初步分析表明,當(dāng)前云南高溫少雨導(dǎo)致草地貪夜蛾生長發(fā)育加快、歷期縮短;草地貪夜蛾繁殖力強(qiáng),單雌產(chǎn)卵量大,種群數(shù)量可在短期內(nèi)激增;草地貪夜蛾幼蟲取食量較大,3齡以后即進(jìn)入暴食期,為害嚴(yán)重;草地貪夜蛾寄主植物廣泛,潛在經(jīng)濟(jì)損失巨大。初步估計(jì),如果不能有效控制其擴(kuò)散和爆發(fā),草地貪夜蛾將可能給云南農(nóng)業(yè)造成高達(dá)2億元以上的損失。
與此同時(shí),華大研究人員對云南的2只草地貪夜蛾(一雌一雄)成蟲個(gè)體進(jìn)行了單管長片段測序技術(shù)建庫、利用華大自主研發(fā)的MGISEQ-2000測序儀進(jìn)行測序,共產(chǎn)出了1.5Tb的基因組測序原始數(shù)據(jù),目前完成了2個(gè)染色體水平的基因組組裝。這是全球首次完成草地貪夜蛾染色體級別的基因組組裝,無論是基因組完整性還是基因集的完整性都超過了目前已有版本。研究中通過基因注釋共發(fā)現(xiàn)了12516個(gè)基因家族。同時(shí),通過對草地貪夜蛾亞型分析表明中國種群有C和R兩種類型;確定有非洲入侵,不排除其他地區(qū)入侵。目前,基因組數(shù)據(jù)已經(jīng)上傳國家基因庫的中國核酸序列歸檔系統(tǒng)(CNSA)數(shù)據(jù)平臺,基因組數(shù)據(jù)已經(jīng)面向全世界公開下載使用。
此外,研究人員通過對不同農(nóng)藥對草地貪夜蛾的室內(nèi)毒力測定發(fā)現(xiàn),毒殺效果發(fā)揮最快速的是甲氨基阿維菌素苯甲酸鹽和甲維茚蟲威,生物農(nóng)藥中蘇云菌對草地貪夜蛾的幼蟲也具有很好的毒殺效果。蠋蝽、叉角厲蝽是2種重要的捕食性蝽類昆蟲,對草地貪夜蛾等鱗翅目害蟲有自然控制作用。
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