畜牧家禽網(wǎng)首頁(yè) > 技術(shù)中心> 三農(nóng)人物 > 余曉文:九年找到水稻“自私的基因”
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近日,國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》發(fā)表突破性成果,在植物體內(nèi)報(bào)道“自私基因”,解開(kāi)了困擾水稻研究多年的雜種不育難題。
論文的第一作者是南京農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院博士余曉文,這距離他“咬”定這一難題已過(guò)去整整9年。在這場(chǎng)科研馬拉松里,秉持“做科研只有第一,沒(méi)有第二”的信念,余曉文的每一天都在“趕跑”。
9年前的6月,本科剛畢業(yè),余曉文就一褲管“插”進(jìn)水稻田,幫師兄到田里插秧,收集實(shí)驗(yàn)樣本。“那年收割的時(shí)候,水稻枝梗粗壯,原本應(yīng)是大豐收,但很多稻谷是空的”。
稻穗“空果”,其實(shí)就是“雜種不育”現(xiàn)象,這正是余曉文的導(dǎo)師、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)萬(wàn)建民院士團(tuán)隊(duì)研究了20多年的水稻雜種優(yōu)勢(shì)利用遇到的難題。
萬(wàn)建民介紹,與秈秈雜交水稻相比,秈粳雜交水稻可進(jìn)一步提高單產(chǎn)15%至30%,然而,同時(shí)會(huì)出現(xiàn)花粉不育、小穗結(jié)實(shí)率低、子粒不飽滿等雜種不育現(xiàn)象。“結(jié)實(shí)率80%是前提,如果達(dá)不到這個(gè)標(biāo)準(zhǔn),就沒(méi)法實(shí)現(xiàn)增產(chǎn)”。
“一定是哪些基因控制了雜交稻不結(jié)實(shí)!”余曉文渴望找出原因。
這塊“硬骨頭”比想象中的還要難啃。2009年,余曉文發(fā)現(xiàn)世界上被報(bào)道的水稻雜種不育相關(guān)位點(diǎn)有50來(lái)個(gè),但被克隆到的基因只有兩個(gè)。這些雜種不育位點(diǎn)大部分只被報(bào)道了大致的遺傳位置,誰(shuí)都可以做,就看誰(shuí)能先做出來(lái)。
科研“無(wú)人區(qū)”的探索注定是考驗(yàn)心智和毅力的。初期的表型考察和遺傳群體分析就讓余曉文花了兩年的時(shí)間。想要找到目的基因所在的區(qū)間,需要在很大的遺傳群體中去篩查重組單株。取葉片進(jìn)行基因型分析,還要采集相應(yīng)植株的稻花觀察花粉是否可育。
很多人不知道水稻也會(huì)開(kāi)花——水稻的穎花是淡黃色的,長(zhǎng)在枝梗上,外觀像小簇的狗尾巴草,個(gè)頭比芝麻還小,采集的時(shí)候必須先固定,然后借助顯微鏡觀察,否則真看不出來(lái)。
水稻花期一般一周左右,由于研究對(duì)象是雄花,必須在一周內(nèi)完成樣品采集,否則至少要再等半年。
水稻的開(kāi)花期在七八月,正值南京火熱的夏季,稻田濕熱,余曉文和師兄妹們要“扎”進(jìn)稻田一株一株精挑細(xì)選,多的時(shí)候,一天采兩三千份樣品,無(wú)異于“蒸籠”地里做“繡花”, 逐個(gè)編號(hào)收集,穎花樣品取回來(lái),通過(guò)顯微鏡觀察是否可育。
白天“蒸籠”地里忙“繡花”,晚上顯微鏡下“穿針線”。“一天要看300個(gè)樣,每個(gè)至少重復(fù)3次,每天觀察統(tǒng)計(jì)實(shí)驗(yàn)將近1000次。”余曉文坦言,強(qiáng)度大的時(shí)候,一天下來(lái)頭昏眼花。
實(shí)驗(yàn)的目的在于證實(shí)或者證偽科研假設(shè)。證實(shí)的話,當(dāng)然功夫不負(fù)有心人,可證偽了呢?余曉文笑笑,“那就只能將一個(gè)夏天的實(shí)驗(yàn)過(guò)程推翻重來(lái)。”
2013年,余曉文找到了讓花粉恢復(fù)可育的基因ORF3,這樣的成果足以在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊發(fā)表一篇高水平論文,申請(qǐng)?zhí)崆爱厴I(yè)了。但田里的“秕谷”在余曉文的腦海中不停閃現(xiàn),ORF3的發(fā)現(xiàn)真的足以揭示雜種不育的分子機(jī)制么?如果沒(méi)有與其相互制約的毒性基因,又是誰(shuí)導(dǎo)致花粉不育呢?
余曉文覺(jué)得可能又面臨“山重水復(fù)疑無(wú)路”。未來(lái)會(huì)怎樣?只能一搏!
2014年,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)首次推行優(yōu)秀博士學(xué)位論文創(chuàng)新工程資助,通過(guò)一定的經(jīng)費(fèi)補(bǔ)助鼓勵(lì)優(yōu)秀博士生科研“不斷檔”,繼續(xù)深入探索,余曉文留了下來(lái)。
當(dāng)時(shí)基因編輯技術(shù)應(yīng)用尚不成熟,余曉文只能用傳統(tǒng)的方法,在很大的群體中進(jìn)行復(fù)雜又嚴(yán)密的遺傳分析。
“看文獻(xiàn)——提假設(shè)——與導(dǎo)師討論——驗(yàn)證或推翻假設(shè)”,余曉文終于找到了讓他“激動(dòng)好幾個(gè)晚上都睡不著覺(jué)”的“MM純合近等基因系”。
他將這一發(fā)現(xiàn)講給導(dǎo)師萬(wàn)建民聽(tīng)。萬(wàn)建民立即拍板,“非常有意思!”并鼓勵(lì)他借鑒跨學(xué)科的方法,繼續(xù)深入下去。
在中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所王海洋、吳傳銀等專(zhuān)家的幫助下,余曉文為40多年前就被提出的水稻雜種不育遺傳假說(shuō)找到了強(qiáng)有力的證明。
余曉文發(fā)現(xiàn),是ORF2這一“狠毒”的基因?qū)е禄ǚ蹟∮?,更有意思的是,ORF2和ORF3這兩個(gè)功能相反基因竟然緊密相連,并且來(lái)自同一個(gè)親本材料,它們共同作用,使得雜交后代攜帶這兩個(gè)基因的個(gè)體數(shù)顯著偏多。
參考動(dòng)物相關(guān)研究,這是一種典型的“自私基因”遺傳模型——經(jīng)典的孟德遺傳定律認(rèn)為,來(lái)自雙親的基因應(yīng)當(dāng)相等概率地分配給下一代,然而“自私基因”會(huì)打破均衡,導(dǎo)致“孩子更像某一方”,而不是“一半像爸爸,一半像媽媽”。
余曉文的發(fā)現(xiàn),第一次突破性地運(yùn)用“自私基因”模型解釋了水稻雜種不育現(xiàn)象。
2016年是余曉文深感壓力的一年。這一年孩子出生,妻子為支持他,辭去工作照顧孩子和家庭,他的研究還有一塊硬骨頭沒(méi)啃完。
為了方便來(lái)去實(shí)驗(yàn)室,夫妻倆在離中國(guó)農(nóng)科院實(shí)驗(yàn)室不遠(yuǎn)的地方租住了一間很小的房子。北京三環(huán)內(nèi)的房租很高,余曉文的補(bǔ)貼勉強(qiáng)湊夠房租和家用。
每年的10月到次年的3月,余曉文像“候鳥(niǎo)”一樣,遷徙到位于海南的南繁基地潛心研究。孩子出生前,余曉文連續(xù)4年春節(jié)沒(méi)回過(guò)老家陪父母。
孩子快1歲時(shí),他將老婆孩子接到南京,但只要導(dǎo)師一個(gè)消息,余曉文就一頭“扎”回北京的實(shí)驗(yàn)室。
“穿著短袖去的,套著羽絨服回來(lái)”,雖然夫妻倆早已適應(yīng)這樣的節(jié)奏,可這次,快一歲半的孩子卻認(rèn)不出爸爸了。余曉文很心酸。他暗自較勁兒,再努力一點(diǎn)、再加快一點(diǎn)!
2017年11月,余曉文將積累8年的成果投給國(guó)際頂級(jí)權(quán)威期刊《科學(xué)》。不到一個(gè)月,《科學(xué)》期刊編輯寄來(lái)了一封回執(zhí)——從摘要到圖注全部詳細(xì)修改,這讓整個(gè)課題組都為之振奮。共同通訊作者、導(dǎo)師王海洋激動(dòng)萬(wàn)分,“頭一次見(jiàn)到!說(shuō)明編輯對(duì)此文非常感興趣!”
2013年發(fā)現(xiàn)“MM純合近等基因系”是余曉文最激動(dòng)的時(shí)刻,但直到此時(shí),他的科研故事才算相對(duì)完整地告一段落,這些年一直懸在心中的石頭也落了下來(lái)。
余曉文并不是團(tuán)隊(duì)的第一位“長(zhǎng)駐”博士。南京農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院院長(zhǎng)朱艷教授說(shuō),“作物育種本身就是一項(xiàng)周期漫長(zhǎng)的工作,要想出大成果,再怎么努力都需要這個(gè)時(shí)間。”
南京農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院鼓勵(lì)學(xué)生從本科實(shí)踐創(chuàng)新項(xiàng)目開(kāi)始,就明確知道自己在干什么,從本科畢業(yè)論文開(kāi)始就能定好研究方向,到碩士和博士階段就要自己來(lái)主導(dǎo)研究。
“博士期間科研有彎路、沒(méi)進(jìn)展,這很正常。”朱艷說(shuō),一要打好基礎(chǔ),二是必須具備良好的抗壓力和意志力。學(xué)校沒(méi)辦法覆蓋到的好的研究,學(xué)院通過(guò)資助和獎(jiǎng)勵(lì)來(lái)補(bǔ)上。
在南京農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,頻繁的匯報(bào)和交流是雷打不動(dòng)的“規(guī)矩”。“余曉文的研究,就是在多次匯報(bào)碰撞以后,導(dǎo)師才覺(jué)得要有好成果了”。
團(tuán)隊(duì)之間每周一次小交流、每月一次大交流。每年一兩次的學(xué)院范圍的大交流都要持續(xù)兩三天,所有研究生都可以對(duì)某個(gè)成果提問(wèn)或給出建議,“我們不贊成導(dǎo)師學(xué)生一對(duì)一的培養(yǎng)模式,我們強(qiáng)調(diào)大團(tuán)隊(duì)意識(shí),高領(lǐng)域的成果必須是交叉協(xié)同的。” 朱艷說(shuō)。
博士生要勇攀前沿,必定有大量交叉學(xué)科,余曉文的研究就涉及遺傳學(xué)、分子生物學(xué)、進(jìn)化生物學(xué)、作物學(xué)等多個(gè)學(xué)科。不論理論積累或?qū)嶒?yàn)技術(shù),都需要花時(shí)間去琢磨。
“坐不住冷板凳的學(xué)生,不會(huì)來(lái)我的團(tuán)隊(duì)”。萬(wàn)建民院士說(shuō),團(tuán)隊(duì)發(fā)掘的水稻半不育基因PSS1花了18年;而水稻部分顯性矮桿多分蘗基因D53則花了25年。
論文發(fā)出的第二天,本應(yīng)是最該分享喜悅的時(shí)刻,余曉文卻又一早回到試驗(yàn)田,開(kāi)始新一季的水稻插秧。
9年前,同樣在這塊地里,他下決心要“啃”下硬骨頭向難題“宣戰(zhàn)”。如今,余曉文試圖將這場(chǎng)“馬拉松”繼續(xù)跑下去:一是驗(yàn)證這一成果到底能為百姓的飯碗增加多少口糧;同時(shí)探尋毒蛋白與解毒蛋白這對(duì)“歡喜冤家”,究竟還隱藏多少不為人知的秘密。
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